Qué se reemplaza y qué se queda
La actualización cambia el contenido propio del modpack, mods, configs, scripts y resource packs que vienen con el pack. Todo lo que generaste jugando, mundos, capturas, lista de servidores, options.txt, mods que añadiste tú, permanece intacto.
En saltos grandes de versión (por ejemplo 1.20 → 1.21) el formato de guardado puede cambiar. Si estás a medio juego, copia la carpeta del mundo antes de actualizar como copia de seguridad.
Locked vs unlocked
Las instancias de modpack vienen bloqueadas por defecto. GDLauncher gestiona los mods del pack y evita conflictos con el manifest. Los mods que añadiste tras desbloquear la instancia se mantienen al actualizar.
Si algo va mal
El mismo botón Change Modpack Version te permite volver a la versión anterior. Si crashea, revisa __logs__ en la instancia. La mayoría se arregla con Settings → Reinstall.