Ce qui est remplacé et ce qui reste
La mise à jour remplace les éléments embarqués par le modpack, mods, configs, scripts et resource packs livrés avec le pack. Tout ce que tu as créé en jouant, mondes, screenshots, liste de serveurs, options.txt, tes mods perso, reste en place.
Sur des sauts de version importants (1.20 → 1.21 par exemple), le format de sauvegarde change parfois. En pleine partie, copie le dossier du monde avant la mise à jour pour avoir un backup.
Verrouillé vs déverrouillé
Les instances de modpack sont verrouillées par défaut. GDLauncher gère alors les mods du pack et évite les conflits avec le manifest. Les mods que tu as ajoutés après déverrouillage restent à travers la mise à jour.
Quand ça coince
Le même bouton Change Modpack Version permet de revenir à la version précédente. Si ça crash, regarde __logs__ dans l'instance. La plupart des cas se règlent avec Settings → Reinstall.